Решение задач на доминантный и рецессивный эпистаз

Информация о материале: Просмотров: 29235

Что такое эпистаз

Гены отвечают за проявление признака в фенотипе. В случае простого менделевского наследования каждый ген отвечает за формирование одного фенотипического признака. Однако в реальности дело обстоит несколько сложнее. Например, один и тот же ген может оказывать влияние на развитие нескольких признаков или один и тот же признак может развиваться под влиянием нескольких генов. Как правило, взаимодействие генов имеет биохимическую природу, то есть оно основано на совместном действии белков, синтез которых контролируется определенными генами. Взаимодействовать друг с другом могут как аллельные, так и неаллельные гены. Взаимодействие нескольких генов, которые расположены в разных локусах называется неаллельным. Неаллельное взаимодействие генов можно разделить на две группы: взаимодействие комплементарных генов и взаимодействие эпистатических генов. В чем заключается различие между ними? Пожалуй можно объяснить это простыми словами. Комлементарные гены - это неаллельные гены, которые действуют совместно на формирование признака, то есть при сочетаниии этих генов в генотипе проявляется новый фенотип. А эпистаз это такое взаимодействие неаллельных генов, при котором один из них подавляет действие другого. Ген, подавляющий действие другого неаллельного гена, называется супрессором или эпистатичным геном, и обозначается буквами I или S. Подавляемый ген называют гипостатичным. Взаимодействовать могут как доминантные, так и рецессивные гены. Поэтому существует доминантный и рецессивный эпистаз. Когда доминантная аллель одного гена подавляет действие другого гена, то это называют доминантный эпистаз. А когда рецессивная аллель эпистатичного гена в гомозиготном состоянии подавляет действие другого гена, то это называют рецессивный эпистаз. Часто неаллельное взаимодействие генов можно объяснить как сточки зрения взаимодействия комплементарных генов так и с точки зрения взаимодействия эпистатических генов. Для комплементарного взаимодействия генов соотношение фенотипов зависят от того, имеют ли эти гены самостоятельное фенотипическое проявление.

9:3:3:1 Эпистаз, выглядящий как независимое распределение

Пример наследования формы гребня у петухов.

Начнем с примера, когда есть взаимодействие не аллельных генов, но соотношение фенотипов выглядит как при независимом распределении . Рассмотрим пример наследования формы гребня у петухов. Форма контролируется генами , которые расположены в двух локусах на разных хромосомах. В результате взаимодействия этих генов петухи могут иметь четыре разных фенотипа. Их гребень может быть гороховидным, розовидным, ореховидным и простым. Wyandotte имеют розовидный гребень. Brahmas имеют гороховидный гребень. И Leghorns имеют простой гребень. Когда скрестили чистые линии Wyandotte и Brahmas, то в первом поколении все петухи имели ореховидный гребень . То есть потомство имело совершенно новый фенотип не такой как родители. От скрещивания особей с ореховидным гребнем во втором поколении было получено потомство в соотношении 9 Ореховидный : 3 Розовидный : 3 Гороховидный : 1 Простой. Таким образом мы имеем дело с тем случаем, когда каждый доминантный ген имеет самостоятельное фенотипическое проявление, сочетание в генотипе двух этих генов обусловливает развитие нового фенотипического проявления, а отсутствие доминантных генов дает другой фенотипический признак. Обозначим гены символами "P" and "R". Если в генотипе есть доминантный аллель "P" и отсутствует доминантный аллель "R", то гребень будет гороховидным. А если в генотипе есть доминантный аллель "R", но нет доминантного аллеля "P", то гребень будет розовидный. Ореховидный гребень будут иметь петухи у которых в генотипе есть оба доминантных гена "P" and "R", а простой гребень будет у гомозигот по обоим рецессивным генам, то есть с генотипом "pprr". Используя правила составления файлов признаков создадим наш файл:

P R:Ореховидный гребень
P:Гороховидный гребень
R:Розовидный гребень
*:Простой гребень

{
гребень:P p
гребень:R r
}

Генетический калькулятор: Вы можете открыть этот файл ( Epistasis 1.txt ) и вычислить результаты сперва для Генотипов, а затем для Фенотипов по признакам. Легко определить, что родительскими генотипами будут "RRpp" для Wyandotte и "rrPP" для Brahmas. В результате этого скрещивания все потомство первого поколения будет иметь генотип "RrPp" c Ореховидным гребнем. А в результате скрещивания гибридов первого поколения мы получим соотношение фенотипов 9 Ореховидных : 3 Розовидных : 3 Гороховидных : 1 Простой. Начиная с версии 3.3, на вкладке программы "Найти" вы можете выбрать любой из этих фенотипов и посмотреть из каких генотипов он был сформирован.

Пример окраски глаз у мухи дрозофилы (Drosophila melanogaster).

Давайте рассмотрим другой пример более подробно. В этом примере также соотношение фенотипов выглядит как при независимом распределении . Плодовая мушка Drosophila melanogaster является популярным объектом многих генетических экспериментов. У плодовой мушки есть большое число форм, которые отличаются по окраске глаз. У мух дикого типа, который распостранен в природе, глаза темно-красные . Существуют мухи с ярко-красными глазами . Этот признак определяется рецессивным аллелем гена, который называется "scarlet" и обозначается как "st". Доминантный аллель этого гена обозначается как "st+". Таким образом мухи с генотипом "stst" будут иметь ярко-красные глаза, а мухи с генотипами "st+st+" и "st+st" будут иметь глаза дикого типа - темно-крсные. Также существуют мухи с коричневыми глазами . Это также рецессивный признак, который определяется геном "brown". Рецессивный аллель этого гена обозначается как "br", а доминантный ген как "br+". И поэтому мухи с генотипом "brbr" будут иметь коричневые глаза, а мухи с генотипами "br+br+" и "br+br" будут иметь глаза дикого типа - темно-красные. Если скрестить мух с ярко-красными глазами и мух с коричневыми глазами то все потомство будет иметь глаза дикого типа (темно-красные), а при скрещивании гибридов первого поколения между собой во втором поколении было получено потомство с соотношением фенотипов 9 темно-красные : 3 ярко-красные : 3 коричневые : 1 белые. Мы можем понять, что происходит взаимодействие двух неаллельных генов "st" и "br". Механизм этого взаимодействия был изучен достаточно хорошо. Окраска глаз у плодовой мушки обусловлена синтезом двух пигментов - красного и коричневого. Рецессивная аллель "br" в гомозиготном состоянии блокирует синтез красного пигмента, поэтому в глазах таких мух будет только коричневый пигмент. Рецессивная аллель "st" в гомозиготном состоянии блокирует синтез коричневого пигмента, поэтому в глазах таких мух будет только красный пигмент. То есть мы описали это взаимодействие с точки зрения эпистатического действия рецессивных генов. Используя правила составления файлов признаков создадим наш файл ( для обозначения дикого типа вместо "st+" и "br+" можно использовать только символ "+" ):

<st> <st> <br> <br>:белые глаза
<st> <st>:ярко-красные глаза
<br> <br>:коричневые глаза
<+>:темно-красные глаза

{
цвет глаз:<+> <st>
цвет глаз:<+> <br>
}

Генетический калькулятор: Вы можете открыть этот файл ( Epistasis 2.txt ) и вычислить результаты сперва для Генотипов, а затем для Фенотипов по признакам. Для получения потомства первого поколения мы должны скрестить плодовых мушек с генотипами <st><st><+><+> ( ярко-красные глаза ), и <+><+><br><br> ( коричневые глаза ). В результате этого скрещивания все потомство первого поколения будет иметь генотип <+><st><+><br> ( темно-красные глаза ). А в результате скрещивания гибридов первого поколения мы получим соотношение фенотипов 9 темно-красные : 3 ярко-красные : 3 коричневые : 1 белые. На вкладке программы "Найти" вы можете выбрать любой конкретный фенотип и посмотреть из каких генотипов он был сформирован.

Пример окраски оперения волнистых попугайчиков.

Рассмотрим пример окраски оперения волнистых попугайчиков. Например, ген "А" обусловливает развитие голубой окраски оперения волнистых попугайчиков, ген "В" - желтой, попугайчики с генотипом "А_В_" - имеют зеленую окраску, а с генотипом "aabb" - белую. Это описание соответствует комплиментарному взаимодействию генов. Используя правила составления файлов признаков создадим наш файл:

A B:зеленые попугайчики
A:синие попугайчики
B:желтые попугайчики
*:белые попугайчики

{
окраска:A a
окраска:B b
}

Однако мы можем рассмотреть этот случай с точки зрения эпистатического взаимодействия генов. Тогда описание этого случае будет выглядеть по другому. Рецессивная аллель "b" в гомозиготном состоянии блокирует действие доминантного аллеля гена "A", поэтому попугаи будут иметь синюю окраску. Рецессивная аллель "a" в гомозиготном состоянии блокирует действие доминантного аллеля гена "B", поэтому попугаи будут иметь желтую окраску. У гомозигот по обоим рецессивным генам, то есть с генотипом "aabb", окраска будет белая. И попугаи будут иметь зеленую окраску во всех остальных случаях. Используя правила составления файлов признаков создадим наш файл:

a a b b:белые попугайчики
b b:синие попугайчики
a a:желтые попугайчики
*:зеленые попугайчики

{
окраска:A a
окраска:B b
}

Вариант эпистатического взаимодействия выглядит более сложным и в данном случае более верным является вариант комплиментарного взаимодействия генов. Ты можешь использовать оба эти варианта. В любом случае результат будут одинаковым.

Генетический калькулятор: Вы можете открыть файлы ( Epistasis 3A.txt или Epistasis 3B.txt ) и вычислить результаты для Фенотипов по признакам. Скрестив зеленых попугаев с генотипом "AaBb" мы получим соотношение фенотипов 9 зеленые : 3 синие : 3 желтые : 1 белые. На вкладке программы "Найти" вы можете выбрать любой из этих фенотипов и посмотреть из каких генотипов он был сформирован.

В рассмотренных взаимодействиях не-аллельных генов изменялось не соотношение фенотипов, а их характер, то есть взаимодействие приводило к появлению совершено новых признаков. Но в большинстве случаев взаимодеиствия не-аллельных генов мы наблюдаем уменьшение числа фенотипических классов, которое происходит в результате объединения каких-то классов. В любом случае в основе взаимодействия двух не-аллельных генов лежит соотношение фенотипов, которое характерно для независимого распределения это 9:3:3:1. При изучении взаимодействия генов необходимо понять какие классы фенотипов объединились и тогда интерпретировать тип взаимодействия. Однако для многих морфологических признаков биохимический механизм проявления генов неизвестен и поэтому часто приходиться ограничиваться только формальной генетической схемой их наследования.

9:6:1 Двойное взаимодействие

Пример формы плодов тыквы.

Как пример можно привести взаимодействие генов, которые определяют форму плода тыквы. Механизм их взаимодействия пока неизвестен. Однако можно заметить, что это взаимодействие генов очень похоже на взаимодействия, которые были описаны выше. В результате взаимодействия двух генов тыквы могут иметь три различных типа форм. Тыквы могут быть сферическими, дисковидными или удлиненными. Когда скрестили чистые линии сферических тыкв с генотипами "AAbb" и "aaBB", то в первом поколении все тыквы имели дисковидную форму. Они были гибридами с генотипом "AaBb". От скрещивания тыкв с дисковидной формой во втором поколении было получено потомство в соотношении 9 дисковидных : 6 сферических : 1 удлиненная. Взаимоотношение генов можно описать с помощью комплементарного взаимодействия генов. Сочетание доминантных аллелей двух генов обеспечивает формирование одного признака, сочетание рецессивных аллелей этих генов - другого, а наличие в генотипе только одного из доминантных генов - третьего. Например, тыквы с генотипом "А_В_" имеют дисковидную форму плода, с генотипом "aabb" - удлиненную, а с генотипами "A_ bb" и "ааВ_" - сферическую. Используя правила составления файлрв признаков создадим наш файл:

A B:дисковидные тыквы
A:сферические тыквы
B:сферические тыквы
*:удлиненные тыквы

{
форма:A a
форма:B b
}

Генетический калькулятор: Вы можете открыть файл ( Epistasis 4.txt ) и вычислить результаты сперва для Генотипов, а затем для Фенотипов по признакам. Для этого случая взаимодействия генов объединяются потомки с генотипами "A_rr " и "aaB_", которые будут иметь общий фенотип. В результате скрещивания гибридов первого поколения мы получим соотношение фенотипов 9 дисковидных : 6 сферических : 1 удлиненная. На вкладке программы "Найти" вы можете выбрать любой из этих фенотипов и посмотреть из каких генотипов он был сформирован.

9:7 Двойной рецессивный эпистаз

Пример окраски цветков у душистого горошка.

Классическим объектом генетических исследований наследования признаков является растение душистого горошка. Когда ученые исследовали окраску цветков этого растения, то они обнаружили, что в некоторых скрещивания соотношение по фенотипу составляло 9:7. То есть при скрещивании двух чистых линий душистого горошка с белыми цветками все растения первого поколения имели пурпурные цветки. A когда скрещивали гибриды из первого поколения, то получали потомство в соотношении 9 пурпурных : 7 белых. Если бы соотношение было 3:1, то мы могли бы предположить, что имеем дело с простым моногибридным скрещиванием, но в данном случае соотношение другое. Поэтому очевидно, что генетический признак окраски цветков душистого горошка контролируeтся двумя неаллельными генами, которые взаимодействуют друг с другом. Для удобства обозначим эти гены, как "C" и "P". Таким образом чистые линии будут иметь генотипы "CCpp" и "ccPP", а гибриды первого поколения соответственно генотип "CcPp". Механизм генетического взаимодействия этих генов стал известен не так давно. Оказалось, что за окраска цветков душистого горошка зависит от синтеза пигментов - антоцианов. Синтез антоцианов происходит в два этапа. За первый этап синтеза отвечает ген "C", а за второй ген "P" и если в генотипе отсутствует доминантный аллель одного из этих генов, то синтеза антоцианов не происходит. То есть можно сказать, что наличие в генотипе рецессивного аллеля в гомозиготном состоянии любого из двух генов блокирует развитие признака окраски цветков. Такое взаимодействие неаллельных генов называется двойным рецессивным эпистазом. Описать это взаимодействие можно так - рецессивная аллель каждого гена в гомозиготном состоянии подавляет действие доминантной аллели другого ("сс" подавляет "P", "pp" подавляет "C"). Файл признаков для этого случая должен быть таким:

c c:белые цветки горошка
p p:белые цветки горошка
*:пурпурные цветки горошка

{
окраска:C c
окраска:P p
}

Взаимоотношение генов можно также описать с точки зрения комплементарного взаимодействия генов. Для этого случая оно будет таким - доминантные и рецессивные аллели комплементарных генов не имеют самостоятельного фенотипического проявления и только сочетание доминантных аллелей двух генов обеспечивает окраску цветков. И тогда Файл признаков можно сформировать по другому:

C P:пурпурные цветки горошка
*:белые цветки горошка

{
окраска:C c
окраска:P p
}

Генетический калькулятор: Вы можете открыть это файлы ( Epistasis 5A.txt или Epistasis 5B.txt ) и вычислить результаты сперва для Генотипов, а затем для Фенотипов по признакам. Для этого случая взаимодействия генов объединяются потомки с генотипами "C_pp" , "ccP_" и "ccpp", которые будут иметь общий фенотип. В результате скрещивания гибридов первого поколения мы получим соотношение фенотипов 9 пурпурных : 7 белых. На вкладке программы "Найти" вы можете выбрать любой из этих фенотипов и посмотреть из каких генотипов он был сформирован.

Пример окраски глаз у мухи дрозофилы (Drosophila melanogaster).

Давайте рассмотрим другой пример двойного рецессивного эпистаза. Еще раз обратимся к наследованию окраски глаз у плодовой мушки, так как вы помните, что у нее есть множество форм, которые отличаются по окраске глаз. Мы уже рассматривали плодовых мушек с ярко-красными глазами. Если в генотипе плодовой мушки есть рецессивный аллель гена "st" ( "scarlet" ) в гомозиготном состоянии, то такие плодовые мушки имеют ярко-красные глаза . Доминантный аллель этого гена обозначается как "st+". Таким образом мухи с генотипом "stst" будут иметь ярко-красные глаза, а мухи с генотипами "st+st+" и "st+st" будут иметь глаза дикого типа - темно-красные. Известно, что кроме рецессивных аллелей "st" синтез бурого пигмента блокируют рецессивные аллели гена "purpule". Обозначим доминантный аллель гена "purpule" как "pr+", а рецессивный как "pr". Плодовые мушки с генотипом "prpr" будут иметь также ярко-красные глаза, а мухи с генотипами "pr+pr+" и "pr+pr" будут иметь глаза дикого типа - темно-красные. Если скрестить две чистые линии плодовых мушек с ярко-красными глазами, то все потомство первого поколения будет иметь глаза дикого типа - темно-красные. А от скрещивания этих гибридов получали потомство в соотношении 9 темно-красные : 7 ярко-красные. Очевидно, что родители с ярко-красными глазами имели генотипы "st+st+prpr" и "ststpr+pr+", а гибриды в первом поколении имели генотип "st+stpr+pr". Для обозначения дикого типа в файле признаков вместо "st+" и "pr+" можно использовать только символ "+":

<st> <st>:ярко-красные глаза
<pr> <pr>:ярко-красные глаза
<+>:темно-красные глаза

{
цвет глаз:<+> <st>
цвет глаз:<+> <pr>
}

И как и в предыдущем примере мы можем описать это взаимодействие в терминах комплементарного взаимодействия генов. Тогда наш файл по признакам будет выглядеть еще проще:

<+>:темно-красные глаза
*:ярко-красные глаза

{
цвет глаз:<+> <st>
цвет глаз:<+> <pr>
}

Генетический калькулятор: Вы можете открыть это файлы ( Epistasis 6A.txt or Epistasis 6B.txt ) и вычислить результаты сперва для Генотипов, а затем для Фенотипов по признакам. Для получения потомства первого поколения мы должны скрестить плодовых мушек с генотипами <st><st><+><+> ( ярко-красные глаза ), и <+><+><pr><pr> ( ярко-красные глаза ). В результате этого скрещивания все потомство в первом поколении будет иметь генотип <+><st><+><pr> ( темно-крсные глаза ). Для этого случая взаимодействия генов объединяются потомки с генотипами "<+><pr>", "<st><+>" и "<st><pr>" , которые будут иметь общий фенотип. В результате скрещивания гибридов первого поколения мы получим соотношение фенотипов 9 темно-красные : 7 ярко-красные. На вкладке программы "Найти" вы можете выбрать любой из этих фенотипов и посмотреть из каких генотипов он был сформирован.

9:3:4 Рецессивный эпистаз

Пример окраски шерсти у кроликов.

В предыдущих примерах мы рассмотрели случаи двойного рецессивного эпистаза, когда рецессивная аллель каждого гена в гомозиготном состоянии подавляет действие доминантной аллели другого. Давайте теперь рассмотрим случай простого рецессивного эпистаза. При одинарном рецессивном эпистазе рецессивная аллель одного гена в гомозиготном состоянии подавляет действие другого доминантного гена ( например "bb" подавляет "A" ). Например, окраска у кроликов определяется двумя комплементарными генами: "P" - наличие окраски, "p" - отсутствие, "В" - черная окраска, "b" - голубая окраска. В данном примере мы имеем два признака в определении - пигмент и цвет. Кролик будет иметь черную шерсть если в его генотипе есть доминантная аллель гена "B", а в противном случае кролик будет иметь голубую шерсть. Но если в генотипе есть рецессивная аллель гена "p" в гомозиготном состоянии ("pp"), то кролик будет альбиносом, даже если в генотипе есть доминантный аллель "B". Другими словами гомозиготная рецессивная аллель "p" подавляет проявление гена окраски "B". Мы можем написать наш файл признаков таким образом:

p p:кролики альбиносы
B:черные кролики
b:голубые кролики

{
пигмент:P p
окраска:B b
}

Можно также описать этот пример как комплементарное взаимодействие генов, когда доминантные и рецессивные аллели комплементарных генов имеют самостоятельное фенотипическое проявление. Если есть два доминантных гена "P" и "B" в генотипе, то кролик будет черным, а если мы имеем только один доминантный аллель "P" тогда кролик будет голубым. Во всех других случаях кролик будет альбиносом. И тогда мы можем записать файл признаков так:

P B:черные кролики
P:голубые кролики
*:кролики альбиносы

{
пигмент:P p
окраска:B b
}

Генетический калькулятор: Вы можете открыть это файлы ( Epistasis 7A.txt or Epistasis 7B.txt ) и вычислить результаты Фенотипов по признакам. Для этого случая взаимодействия генов объединяются потомки с генотипами "ppB_" и "ppbb", которые будут иметь общий фенотип. В результате скрещивания гибридов с генотипом "PpBb" мы получим соотношение фенотипов 9 черных : 3 голубых : 4 альбиноса. На вкладке программы "Найти" вы можете выбрать любой из этих фенотипов и посмотреть из каких генотипов он был сформирован.

13:3 Доминантный и рецессивный эпистаз

Пример окраски венчиков у примулы.

Итак мы рассмотрели случаи рецессивного эпистаза, но в природе часто можем встретить и случаи доминантного эпистаза. Доминантным эпистазом называют подавление действия гена доминантной аллелью другого гена. Рассмотрим это на примере наследования окраски цветков растения примулы. При наличии вещества, которое называется мальвидин, цветки будут окрашены в голубой цвет. Синтез мальвидина обусловлен наличием в генотипе доминантного аллеля гена "K". Если же этот ген в генотипе представлен рецессивной аллелью в гомозиготном состоянии "kk", то мальвидин не синтезируется и цветки будут не окрашенными (белые). Но есть также другой ген, который находиться в совершенно другом локусе и который влияет на формирование окраски. Обозначим этот ген как "D". Оказалось, что если в генотипе есть доминантный аллель гена "D", то в не зависимости от наличия или отсутствия доминантного аллеля гена "K" в генотипе, цветки этого растения будут также не окрашенные. Можно сказать, что доминантный аллель гена "D" подавляет действие гена "K", то есть подавлет синтез мальвидина. Если скрестить не окрашенные гетерозиготные растения с генотипом "DdKk", то в потомстве мы получим соотношение по фенотипу 13 белых : 3 голубых. Файл признаков для этого случая должен быть таким:

D:белые цветки
K:голубые цветки
k:белые цветки

{
пигмент:D d
окраска:K k
}

Генетический калькулятор: Вы можете открыть это файл ( Epistasis 8.txt ) и вычислить результаты Фенотипов по признакам. Для этого случая взаимодействия генов объединяются потомки с генотипами "D_K_", "D_kk" and "ddkk", которые будут иметь общий фенотип. В результате скрещивания гибридов с генотипом "PpBb" мы получим соотношение фенотипов 13 белые : 3 голубые. На вкладке программы "Найти" вы можете выбрать любой из этих фенотипов и посмотреть из каких генотипов он был сформирован.

12:3:1 Доминантный эпистаз

Пример окраска шерсти у собак.

Этот пример очень похож на предыдущий. Но в данном случае такое соотношение по фенотипу наблюдается когда гомозиготная по рецессивным признакам особь имеет особый фенотип. Рассмотрим на примере наследования окраски шерсти у собак. За окраску шерсти отвечает ген "B". Если в генотипе есть доминантный аллель этого гена, то собака будет черной, а в противном случае собака будет коричневой. На окраску шерсти влияет и другой не аллельный ген "I". И в любом случае, если мы имеем доминантную аллель "I" в генотипе собака будет только белой. Таким образом щенки с генотипом "I_bb" имеют белую окраску, с генотипом "iiB_" - черную, а с генотипом "iibb" - коричневую. Файл признаков для этого случая должен быть таким:

I:белые собаки
B:черные собаки
b:коричневые собаки

{
пигмент:I i
окраска:B b
}

Генетический калькулятор: Вы можете открыть это файл ( Epistasis 9.txt ) и вычислить результаты Фенотипов по признакам. Для этого случая взаимодействия генов объединяются потомки с генотипами "I_B_" и "I_bb", которые будут иметь общий фенотип. В потомстве от cкрещивания двух дигетерозиготных собак с генотипом "IiBb" мы получим соотношение фенотипов 12 белых : 3 черных : 1 коричневых. На вкладке программы "Найти" вы можете выбрать любой из этих фенотипов и посмотреть из каких генотипов он был сформирован.

15:1 Двойной доминантный эпистаз

Пример окраски зерен пшеницы.

Соотношение фенотипов 15:1 характерно для двойного доминантного эпистаза. Два предыдущих примера мы рассмотрели исключительно с точки зрения эпистатического взаимодействия генов. Описать с точки зрения комплиментарного взаимодействия генов два этих примера было бы затруднительно. Но для этого случая больше подойдет именно описание с точки зрения комплементарного взаимодествия генов, так как это больше соответствует биохимическому механизму формирования данного признака. Зерно пшеницы может быть окрашенно и неокрашенно. Окраска зерна у пшеницы зависит от биохимической реакции в результате которой вещество предшественник (precursor) трансформируется в пигмент. Эта реакция протекает под дествием продуктов, которые синтезируются двумя генами "A" and "B". Причем данная биохимическая реакция возможна как при наличии в генотипе доминантных аллелей обоих этих генов, так и при наличии доминантного аллеля только одного из этих генов. Если в генотипе доминантные аллели отсутствуют, то зерно будет белым, то есть неокрашенным. Таким образом пшеница с генотипами "A_B_", "A_bb" and "aaB_" будут иметь окрашенные зерна, и только растения с генотипом "aabb" будет иметь неокрашенные зерна. Файл признаков для этого случая должен быть таким:

A:окрашенное зерно
B:окрашенное зерно
*:не окрашенное зерно

{
окраска:A a
окраска:B b
}

Генетический калькулятор: Вы можете открыть это файл ( Epistasis 10.txt ) и вычислить результаты Фенотипов по признакам. Для этого случая взаимодействия генов объединяются потомки с генотипами "A_B_", "A_bb" and "aaB_", которые будут иметь общий фенотип. В результате скрещивания гибридов с генотипом "AaBb" мы получим соотношение фенотипов 15 окрашенные : 1 не окрашенные. На вкладке программы "Найти" вы можете выбрать любой из этих фенотипов и посмотреть из каких генотипов он был сформирован.

Иногда, когда мы имеем дело с рецессивным эпистазом файлы признаков выглядят довольно сложными. Например в случае окраски оперения у волнистых попугайчиков:

a a b b:белые попугайчики
b b:синие попугайчики
a a:желтые попугайчики
A:зеленые попугайчики

{
окраска:A a
окраска:B b
}

Когда мы работаем с рецессивными эпистатичными генами мы должны обозначать их как два рецессивных аллеля. Это необходимо для получения корректных результатов. Если вы обозначите эпистатический ген только как один рецессивный аллель, то вы получите неверное соотношение для Фенотипов по признакам.

a b:белые попугайчики
b:синие попугайчики
a:желтые попугайчики
A:зеленые попугайчики

{
окраска:A a
окраска:B b
}

Дело в том, что в программе соотношение для Фенотипов по признакам формируется по соотношению генотипов и если вы сформируете файл признаков так, то некоторые генотипы будут интерпретированны не верно. Например белый цвет должен быть у попугаев только с генотипом "aabb", но генотипы "AaBb", "aaBb", "Aabb" будут также отнесены к попугаям с белым цветом. Есть ли возможность использовать такого типа файлы признаков? Да конечно. Выберите тип результатов - Фенотипы и посмотрите как выглядят фенотипы в программе. Вы можете видеть, что в фенотипе каждый ген представлен в виде одного аллеля - "AB", "Ab", "aB", "ab". Таким образом если Фенотипы по признакам будут формироваться по соотношению фенотипов, то результаты будут корректными. Для этого вам необходимо отметить флажок "Из фенотипов". Вы можете открыть это файл ( Epistasis 3C.txt ) и вычислить результаты Фенотипов по признакам.

Если вы хотите использовать эту возможность, то вы должны четко понимать что и как вы делаете. Если вы имеете дело одновременно с аллельным и неаллельным взаимодействием генов, то от этой возможности придеться отказаться, потому что в этом случае фенотипы по признакам должны формироваться только по соотношению генотипов. Если вы все сделаете правильно, то вы получите корректный результат. Не бойтесь, эксперементируйте и у вас все получится.

Продукт:	Генетический калькулятор
Версия:	4.0 final
Размер:	14.3 Mb
Язык:	En / Ru
Лицензия:	Бесплатная
ОС:	Win XP/Vista/7/8